מכון בית אהרן וישראל הוקם בשנת תשמ"ו בעיה"ק ירושלים ת"ו, בידי מרכז מוסדות קארלין סטולין בארץ הקודש.

מאז הוקם, זכה המכון להוציא לאור ספרי הלכה, שו"ת, אגדה וחסידות. הרוב המכריע מבין הספרים יוצא לאור מתוך ספריית כתבי היד בגנזי כ"ק מרן אדמו"ר מקרלין סטולין שליט"א, המטפח אוצר עשיר ורב גוונים של כתבי יד בכל מקצועות התורה וההלכה, ומכל גווני הקשת – גאוני אשכנז, חכמי ספרד וצדיקי החסידות לדורותיהם.

הבריח התיכון של המכון הוא הקובץ התורני – 'קובץ בית אהרן וישראל' היוצא לאור מדי חודשיים, מלא וגדוש מזן אל זן בתורתם של חכמי ורבני הישיבות והכוללים של מרכז סטאלין קארלין, הבלולה יחד עם חידושי תורה ובירורי הלכה המגיעים מכל קצוות תבל ומכל חוגי היהדות התורתית לעדותיה.

'קובץ בית אהרן וישראל' כולל בתוכו מדורים מיוחדים לחידושי תורה, בירורי הלכה, תיקוני סופרים, לצד מנהגי ישראל, ספונות ומחקרי דברי הימים. בראש המדורים עומד בשיא יפיו מדור 'גנוזות', בו נחשפים תמידין כסדרן מתורתן של ראשונים כמלאכים, חכמי ספרד ואשכנז לדורותיהם, כשהם מופיעים בהידור, מתוך פיענוח דקדקני של כתבי היד, עיון בתוכנם, השוואתם ומילוי מראי מקומות.